蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院及 AB SCIEX（的生命科學(xué)分析技術(shù)公司）的科學(xué)家匯聚一堂，公布一項(xiàng)基于質(zhì)譜應(yīng)用的新技術(shù)，利用此項(xiàng)技術(shù)，科學(xué)家有史以來(lái)可以獲得單獨(dú)蛋白質(zhì)組學(xué)樣品分析中每個(gè)肽段的數(shù)據(jù)。S WATH 采集模式 是一項(xiàng)重大技術(shù)突破，使用質(zhì)譜研究蛋白質(zhì)組學(xué)的用戶得以獲知整個(gè)蛋白質(zhì)組的完整數(shù)據(jù)。在與蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院 Ruedi Aebersold 博士進(jìn)行的 MRMAtlas 合作的過(guò)程中，AB SCIEX 將開發(fā) MS/MSALL 增強(qiáng)功能，使 AB SCIEX TripleTOF™ 5600 系統(tǒng)可以運(yùn)行 SWATH 采集模式供科學(xué)家使用。有關(guān) SWATH 的詳情將于本周在丹佛召開的美國(guó)質(zhì)譜協(xié)會(huì) （American Society of Mass Spectrometry, ASMS） 會(huì)議上公布。 SWATH 采集模式是 Aebersold 博士及其在蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的團(tuán)隊(duì)共同開發(fā)，為未來(lái)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供的一種新的工作流程，該系統(tǒng)預(yù)計(jì)將產(chǎn)生令人震撼的蛋白質(zhì)組學(xué)新發(fā)現(xiàn)，并克服目前的質(zhì)譜平臺(tái)中因數(shù)據(jù)重復(fù)而給科學(xué)家?guī)?lái)的困惑。本技術(shù)關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)在于其能提供樣品的完整定量與定性結(jié)果，該結(jié)果能按照提出的新假設(shè)經(jīng)電腦模擬進(jìn)行回溯性的挖掘。 這一新技術(shù)是對(duì) MRMAtlas 的補(bǔ)充，MRMAtlas 以質(zhì)譜技術(shù)為基礎(chǔ)，向大多數(shù)人類蛋白質(zhì)組提供研究平臺(tái)?？茖W(xué)家利用這一圖譜極大推進(jìn)了生物標(biāo)志物研究、蛋白藥物開發(fā)、基礎(chǔ)生物及生物醫(yī)學(xué)研究。MRMAtlas 提供簡(jiǎn)單及有效分析能力，探索蛋白質(zhì)組中前所未見的新領(lǐng)域。利用 TripleTOF 5600 系統(tǒng)的 SWATH 采集模式，將有更多科學(xué)家能使用 MRMAtlas。 現(xiàn)有高分辨率及軌道阱質(zhì)譜系統(tǒng)僅能定性檢測(cè)出復(fù)雜樣品中的蛋白質(zhì)子集，因?yàn)樗鼈?MS/MS 獲取速度相對(duì)較慢，且為探知更準(zhǔn)確的定量結(jié)果，常常會(huì)采用其他儀器再次進(jìn)樣分析樣品。面對(duì)這些挑戰(zhàn)，AB SCIEX 開發(fā)出 SWATH 采集模式可以在單一進(jìn)樣分析中同時(shí)對(duì)所有蛋白質(zhì)與肽進(jìn)行定量與定性檢測(cè)。 與 Aebersold 博士及其團(tuán)隊(duì)共同展開的這一活動(dòng)還將繼續(xù)開發(fā)軟件處理方法，更好解析 MRMAtlas 的數(shù)據(jù)。SWATH 采集模式 是 AB SCIEX 的 MS/MSALL 技術(shù)的延伸，只能在 TripleTOF™ 5600 上完成，這是因?yàn)樾枰獙?的采集速度與定量能力、質(zhì)量及高分辨率整合在一起方可實(shí)現(xiàn)。MS/MSALL 以前已成功用于脂質(zhì)組學(xué)及特種結(jié)構(gòu)表達(dá)?，F(xiàn)在進(jìn)一步擴(kuò)展此能力，MS/MSALL 采用 SWATH 采集模式，極大提高了工作效率，因此可以結(jié)合 LC/MS --， 顯著提高了質(zhì)譜技術(shù)。 |
