關于小分子RNAs的沉默機制已經得到了多方面的認可，由此也榮獲了2006年的諾貝爾獎，這種針對基因調控和基因組防御方面的作用機制，令小分子RNA生物合成序列選擇多種多樣，也預示著多種新機制。在一項新研究中，研究人員發(fā)現了一種稱為停滯剪接（stalled spliceosomes，生物通譯）的作用機制，能作為小分子RNA生物合成的一種誘導起始物，從而用于基因沉默和生物防御。
這項研究公布在Cell雜志上，來自美國西北大學的Karen S. Kim Guisbert和Erik J. Sontheimer特以“Quit Stalling or Youll Be Silenced”為題，介紹了這項成果，他們指出這種能被RNA沉默機器識別的信號，表明了剪接具有生物防御的功能。
選擇性剪接（也叫可變剪接）是指從一個mRNA前體中通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點組合）產生不同的mRNA剪接異構體的過程，而zui終的蛋白產物會表現出不同或者是相互拮抗的功能和結構特性，或者，在相同的細胞中由于表達水平的不同而導致不同的表型。
剪接與基因沉默關系密切，今年1月，一組研究人員就通過分析比較了86個不同真核基因組序列，分析了小RNA輔助因子的系統發(fā)生譜，并指出，在RNA剪接和小RNA介導的基因沉默之間存在密切關聯（1月31日Nature）。
在這篇文章中，研究人員以一種致病真菌：新型隱球菌為研究對象，發(fā)現當細胞剪接機器遇到轉座子這樣的內含子時，就會停滯，而一種稱為剪接體耦合核RNA干擾（Spliceosome-Coupled And Nuclear RNAi，SCANR，生物通譯）復合物的作用機制，能識別這一故障，啟動合成相應的小分子RNA，用來中和轉座子的RNA，這樣就能有助于識別外源基因并加以抵御。
轉座子是一類廣泛存在，能夠在基因組中通過轉錄或逆轉錄，在內切酶的作用下，在其他基因座上出現的DNA序列，研究表明，轉座子異常跳躍，如插入到重要基因中，就會使基因功能出現故障，引發(fā)疾病或出生缺陷。而SCANR作用機制能像免疫系統一樣，區(qū)分自我和非我的序列，識別外源的入侵者，防止由于轉座子異常跳躍引發(fā)的疾病。
這項研究表明，mRNA前體在剪接體上的停滯作用，是siRNA積累過程的必需元件，而SCANR復合物對mRNA前體的識別，能與沉默產生動力學競爭，從而促進siRNA生成。
